Одновременно с реконструкцией береговой зоны Верхнего озера городской администрацией проводится серьезная работа по его экологическому оздоровлению.

На совещании под руководством главы администрации Феликса Лапина председатель комитета городского хозяйства Данута Смирнова доложила о ходе выполнения постановления «Об улучшении санитарно-экологического состояния озера Верхнее». По информации МУП «Водоканал», аварийные выпуски хозяйственно-бытовых сточных вод в озеро Верхнее, реку Голубую, ручей Северный и канал К-1 отсутствуют.

В течение полугода были обследованы берега озера, все его притоки. Выявлены источники загрязнения, определены хозяева стоков. Всем нарушителям были выданы предписания, их выполнение постоянно контролируется. Из 39 предписаний, выданных муниципальным предприятием «ЭДИС», 26 уже выполнены собственниками.

Домовладельцы предоставили проектную документацию на отвод бытовых стоков, в ряде случаев - договоры и квитанции об оплате за обслуживание выгребных ям и септиков. «Балткран» восстановил штатную канализацию и прекратил сброс стоков в ручей Северный с территории предприятия. Садоводческие общества «Янтарь», «Дачное», «Калачево», «Дружба» ликвидировали недействующие дренажные выпуски, на рабочих - смонтировали оголовки для предотвращения размыва берега. ЗАО «Навигатор Тур» представило анализы сточных вод после очистных сооружений. Гаражные общества «Авиатор-2», «Чкаловск-1» и ОАО «СЗТ Калининградский филиал» оборудовали колодцы с корзинами, заполненными фильтрующей загрузкой. ООО «ПБРК» представлена согласованная проектная документация на отвод дождевых и дренажных вод, выполнены работы по устройству оголовка. ООО «Ремжилстрой-Инвест» произведен тампонаж выпусков, представлена исполнительная документация дождевой канализации и дренажа. МУП  «Водоканал» и ИК-9 затампонировали недействующие выпуски.

МУП «ЭДИС» получило промежуточную информацию по реализации остальных предписаний и продлило сроки их выполнения. В комитете городского хозяйства, в администрациях Центрального и Ленинградского районов назначены ответственные за предотвращение загрязнения озера и водотоков.

Новая мелиоративная система, проект которой заказан институту «Запводпроект», позволит заметно оздоровить гидрологическую ситуацию в бассейне Верхнего озера. Она осушит большие городские территории в Ленинградском районе, а локальные очистные сооружения на 12 выпусках дренажной канализации уберегут «городскую жемчужину» от возможных загрязнений во время сильных дождей. После положительного заключения по проекту появится возможность заявить дополнительные средства в сумме 700 миллионов рублей из федерального бюджета на 2010-2011 годы.