Братская могила на территории Свято-Никольского женского монастыря образована в 2000 году, в ней захоронены останки тридцати шести советских воинов погибших на территории г. Калининград при штурме города- крепости Кёнигсберг в апреле 1945 года и обнаруженные при строительстве здания, а также получивших ранения и умерших в госпитале.
Церемония перезахоронения прошла 22 июня 2001 года с соблюдением церковных традиций и воинских почестей.
В 2005 году на воинском захоронении был установлен православный крест из черного мрамора высотой 2 м. Перед крестом расположена плита с надписью "Здесь покоятся воины, павшие при взятии Кёнигсберга в апреле 1945 года" и высеченными фамилиями тридцати погибших, фамилии шести воинов неизвестны. Разбит цветник, территория площадью 20 квадратных метров обнесена невысоким парапетом.
Имена большинства известных воинов увековечены и на мемориальном комплексе в в микрорайоне А. Космодемьянского.
В мае 2013 года южнее первой братской могилы были захоронены останки сорока девяти воинов, эксгумированных из района Бальги.
В мае 2015 года южнее второй братской могилы были захоронены останки четырнадцати воинов, эксгумированных в Краснознаменском районе.